Estimering af omkostningerne ved skræddersyet software-udvikling kræver en dyb forståelse af projektets krav og kompleksitet. Overvej faktorer som udviklingstid, antal udviklere, teknologier, der skal bruges, og tredjepartsressourcer. Også, inkluder omkostninger til projektledelse, QA, deployment, efterfølgende support og vedligeholdelse. Brug eventuelt tidligere projekter som benchmark for at opnå en mere nøjagtig vurdering.